Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sall3Q62255 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms