Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxd4Q60688 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms