Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a3Q5XF89 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms