Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms