Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm27Q5SFM8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm27Q5SFM8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm27Q5SFM8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms