Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tmprss11eQ5S248 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss11eQ5S248 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss11eQ5S248 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss11eQ5S248 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss11eQ5S248 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tmprss11eQ5S248 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss11eQ5S248 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tmprss11eQ5S248 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tmprss11eQ5S248 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tmprss11eQ5S248 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Tmprss11eQ5S248 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tmprss11eQ5S248 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tmprss11eQ5S248 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmprss11eQ5S248 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms