Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef6Q5NCJ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef6Q5NCJ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms