Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt2Q5DTW2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms