Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shank3Q4ACU6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms