Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Esf1Q3V1V3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Esf1Q3V1V3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Esf1Q3V1V3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms