Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp48Q3V0C5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms