Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trat1Q3UU67 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms