Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BB287469Q3UT53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms