Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms