Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mier3Q3UHF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms