Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms