Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rasip1Q3U0S6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms