Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc9Q3U0M1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms