Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrx1Q3TL44 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms