Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
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Tdrd9Q14BI7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tdrd9Q14BI7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tdrd9Q14BI7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tdrd9Q14BI7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tdrd9Q14BI7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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Tdrd9Q14BI7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms