Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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ptchd1Q14B62 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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ptchd1Q14B62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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ptchd1Q14B62 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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ptchd1Q14B62 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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ptchd1Q14B62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ptchd1Q14B62 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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ptchd1Q14B62 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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ptchd1Q14B62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ptchd1Q14B62 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms