Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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