Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms