Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ttc39dQ0VF76 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ttc39dQ0VF76 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ttc39dQ0VF76 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ttc39dQ0VF76 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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