Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd12Q0VE29 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd12Q0VE29 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms