Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem52bQ0VBF2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms