Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kndc1Q0KK55 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms