Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CbfbQ08024 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms