Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Col6a2Q02788 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col6a2Q02788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms