Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms