Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RykQ01887 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RykQ01887 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RykQ01887 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RykQ01887 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RykQ01887 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RykQ01887 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RykQ01887 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms