Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SelpQ01102 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SelpQ01102 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelpQ01102 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelpQ01102 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelpQ01102 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SelpQ01102 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SelpQ01102 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SelpQ01102 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SelpQ01102 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms