Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neo1P97798 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neo1P97798 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neo1P97798 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neo1P97798 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neo1P97798 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms