Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b3P97370 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225 ms