Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhodP97348 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhodP97348 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhodP97348 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhodP97348 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhodP97348 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhodP97348 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhodP97348 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RhodP97348 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhodP97348 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms