Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vgll3P85442 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll3P85442 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms