Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms