Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad50P70388 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms