Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tbx6P70327 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms