Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfixP70257 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfixP70257 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NfixP70257 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfixP70257 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfixP70257 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfixP70257 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfixP70257 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfixP70257 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfixP70257 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NfixP70257 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NfixP70257 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfixP70257 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfixP70257 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NfixP70257 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfixP70257 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfixP70257 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfixP70257 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfixP70257 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfixP70257 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NfixP70257 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfixP70257 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms