Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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