Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElobP62869 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElobP62869 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElobP62869 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElobP62869 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ElobP62869 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ElobP62869 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ElobP62869 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ElobP62869 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ElobP62869 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms