Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms