Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Polr2fP61219 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms