Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf13P61216 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms