Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps5P59438 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps5P59438 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hps5P59438 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hps5P59438 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps5P59438 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps5P59438 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps5P59438 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps5P59438 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps5P59438 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps5P59438 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hps5P59438 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms