Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp25P57080 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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