Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bace1P56818 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace1P56818 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms