Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp5P56399 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp5P56399 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp5P56399 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms