Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms